Cromatograma

Plotando dados de rastreamento de cromatograma de DNA

Plotando dados de rastreamento de cromatograma de DNA
  1. Como você lê um cromatograma de sequência de DNA?
  2. O que um cromatograma de DNA diz a você?
  3. Como você analisa dados de sequenciamento de Sanger?
  4. O que é cromatograma em bioinformática?

Como você lê um cromatograma de sequência de DNA?

As bases são lidas em ordem da esquerda para a direita e de cima para baixo (em um cromatograma com mais de uma fileira de informação). Esta ordem corresponde ao final de 5 'do DNA sequenciado para a extremidade 3'. Tão picos tão bem espaçados e claros tornam a base chamada direta e inequívoca.

O que um cromatograma de DNA diz a você?

Sequenciadores de DNA automatizados geram um cromatograma de quatro cores mostrando os resultados da corrida de seqüenciamento, bem como o melhor palpite de um programa de computador em interpretar esses dados --- um arquivo de texto de dados de sequência.

Como você analisa dados de sequenciamento de Sanger?

A análise de sequenciamento de Sanger é realizada de forma comparativa, onde o eletroferograma do paciente é comparado com um eletroferograma de uma amostra de DNA sem mutação. Quaisquer diferenças observadas entre os dois traços são registradas e analisadas por seu potencial efeito patogênico na proteína.

O que é cromatograma em bioinformática?

Um cromatograma (às vezes também chamado de eletroferograma) é a representação visual de uma amostra de DNA produzida por uma máquina de sequenciamento (como o sistema de detecção de sequência Applied Biosystems ABI Prism 7700).

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