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- Quais são as vantagens do alinhamento de múltiplas seqüências?
- Qual é a desvantagem do alinhamento de sequência múltipla progressiva que usa uma árvore orientadora?
- Por que a sequência de DNA é menos confiável para o alinhamento de seqüências múltiplas?
- O que é problema de alinhamento de sequência?
Quais são as vantagens do alinhamento de múltiplas seqüências?
Há uma vantagem única do alinhamento de seqüências múltiplas porque revela mais informações biológicas do que muitos alinhamentos em pares podem. Por exemplo, permite a identificação de padrões e motivos de sequência conservados em toda a família de sequência, que não são óbvios para detectar comparando apenas duas seqüências.
Qual é a desvantagem do alinhamento de sequência múltipla progressiva que usa uma árvore orientadora?
O MSA progressivo é uma das abordagens mais rápidas, consideravelmente mais rápidas do que a adaptação de alinhamentos pares com várias seqüências, que podem se tornar um processo muito lento para mais do que algumas sequências. Uma grande desvantagem, no entanto, é a dependência de um bom alinhamento das duas primeiras sequências.
Por que a sequência de DNA é menos confiável para o alinhamento de seqüências múltiplas?
O tamanho pequeno do 'alfabeto' do DNA torna o alinhamento das sequências nucleotídicas inerentemente difícil: mesmo um par de sequências de DNA completamente não relacionadas normalmente exibem identidade de 25% em todo o seu comprimento e geralmente é possível encontrar alinhamentos locais prolongados onde >50% dos nucleotídeos alinhados são ...
O que é problema de alinhamento de sequência?
O problema de alinhamento da sequência é um dos problemas fundamentais das ciências biológicas, com o objetivo de encontrar a semelhança de duas sequências de aminoácidos. Comparar aminoácidos é de primordial importância para os seres humanos, pois fornece informações vitais sobre evolução e desenvolvimento.
